Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDNQ13061 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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