Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms