Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms