Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRJQ12913 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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