Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms