Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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