Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TFF3Q07654 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms