Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms