Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms