Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNC4Q03721 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms