Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4A11Q02928 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms