Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms