Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNC1Q01954 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms