Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms