Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms