Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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