Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RPS29P62273 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RPS29P62273 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RPS29P62273 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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