Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAP25P60880 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms