Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAV3P56539 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAV3P56539 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAV3P56539 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CAV3P56539 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAV3P56539 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms