Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms