Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SMARCA2P51531 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMARCA2P51531 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms