Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FNTBP49356 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FNTBP49356 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms