Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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