Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL1P40616 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL1P40616 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL1P40616 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms