Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms