Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC1P35052 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms