Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC1P33527 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms