Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBL1P28749 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBL1P28749 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms