Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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