Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHCEP18577 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHCEP18577 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHCEP18577 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHCEP18577 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHCEP18577 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms