Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XBP1P17861 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XBP1P17861 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XBP1P17861 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms