Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB3P16520 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB3P16520 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB3P16520 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms