Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms