Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR2F1P10589 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms