Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD2P0DJD1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD2P0DJD1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms