Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD63P08962 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD63P08962 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD63P08962 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms