Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLK3P07288 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms