Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPBP07199 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms