Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC1P02654 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC1P02654 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms