Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA1P02647 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOA1P02647 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms