Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV3-15P01624 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms