Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX7O95931 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms