Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2A1O95782 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2A1O95782 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms