Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HERC2O95714 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HERC2O95714 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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