Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEBLO76041 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEBLO76041 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEBLO76041 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEBLO76041 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEBLO76041 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms