Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5O75197 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5O75197 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRP5O75197 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms