Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHP4O75161 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms