Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP3O75154 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11FIP3O75154 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms