Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG13O75143 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG13O75143 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms