Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLIN3O60664 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms